В сфере аудита работает с 1995 года. В н.в. заместитель генерального директора компании "Пачоли". Участвует в проведении мониторинга системы контроля качества услуг организаций, входящих в сеть Nexia International и Nexia CIS.
Член Комиссии по контролю качества СРО "Аудиторская Ассоциация Содружество", член Комиссии по контролю качества работы Рабочего органа Совета по аудиторской деятельности при Минфина РФ.
Анна Кунегина – признанный эксперт и один из первых внешних контролеров качества в РФ.